Kardinál Stanislav Dziwisz uvádza, že k incidentu došlo počas pápežovej návštevy pútnickeho miesta v portugalskej Fatime. V roku 1917 tam tri malé deti tvrdili, že sa im opakovane zjavuje Panna Mária.
12. mája 1982 tam Ján Pavol II. zavítal, aby sa poďakoval za to, že prežil predchádzajúci útok na Svätopeterskom námestí vo Vatikáne rok predtým. Vtedy 13. mája 1981 ho na námestí postrelil turecký atentátnik Ali Agca.
Vo Fatime na neho zaútočil ultrakonzervatívny španielsky kňaz Juan Fernandez Krohn. Ten bol odporcom Druhého vatikánskeho koncilu a odmietal zmeny v cirkvi. Jána Pavla II. považoval za komunistu a agenta KGB, ktorý má za úlohu cirkev zvnútra rozvrátiť. Na pápeža zaútočil nožom a zranil ho na ruke. Ľudia stojaci v okolí Jána Pavla II. však atentátnika zvalili na zem a znemožnili mu zasadiť ďalšie rany.
„Teraz už môžem povedať, že Svätý otec bol zranený. Na jeho rukách bola krv,“ cituje slová kardinála Dziwisza portál Aktuálně.cz. Hlava katolíckej cirkvi sa však rozhodla udalosť nezverejniť a Juana Fernandeza Krohna v Portugalsku v tichosti odsúdili na šesť rokov väzenia. Odsedel si len tri, cirkev neskôr opustil.
Dodnes je však nejasné pozadie prvého atentátu z roku 1981. Talianska vyšetrovacia komisia dospela k záveru, že pokus o vraždu pápeža zorganizovala sovietska KGB za pomoci bulharskej tajnej služby.