Pozmeňujúci návrh prináša aj ďalšie zmeny. Pre neziskovú organizáciu, nadáciu či združenie s ročným príjmom nad 35-tisíc eur sa má zaviesť povinnosť vypracúvať výkaz o transparentnosti. Obsahom výkazu by mali byť aj informácie o osobách, ktoré prispeli na činnosť organizácie za rok viac ako 5000 eur. Rovnako by sa v ňom mali zverejňovať aj identifikačné údaje orgánov alebo členov orgánu organizácie.
Mimovládne neziskové organizácie, ktorým bol poskytnutý jednorazový príspevok z verejných zdrojov v sume najmenej 3330 eur alebo v rámci jedného roku dostali verejné zdroje v úhrnnej zmluve najmenej 10-tisíc eur, by sa po novom tiež mali stať povinnými osobami. Mali by byť teda povinné sprístupňovať informácie, a to iba o hospodárení s danými prostriedkami.
V pozmeňujúcom návrhu Čellár navrhol vypustiť bod, ktorý hovoril o regulácii lobingu. Viacerí koaliční predstavitelia však avizovali, že lobing sa bude riešiť samostatnou legislatívou. Pozmeňujúci návrh posúva aj účinnosť novely z 1. januára 2025 na 1. jún 2025.