Benedikt XVI. vo svojom záverečnom prejave, ktorý na letisku predniesol v angličtine, poďakoval za pohostinnosť Klausovi, zástupcom cirkvi, všetkým dobrovoľníkom, ktorí sa podieľali na zabezpečení akcií a aj veriacim.
Pozitívne sa vyjadril o všetkých bodoch svojho trojdňového programu. Za mimoriadne potešujúce označil stretnutie s mládežou a pripomenul pri tej príležitosti výrok, ktorý sa pripisuje českému autorovi Franzovi Kafkovi: „Kto si zachová schopnosť vidieť krásu, nikdy nezostarne.“
Klaus svoj prejav predniesol v taliančine a uviedol v ňom, že pápežova návšteva bola mimoriadne úspešná a posilnila vzťahy Českej republiky s Vatikánom. Prezident vyzdvihol Benediktovu odvahu „vyjadriť názory, ktoré nie sú politicky korektné a ktorým sa vždy netlieska“. Česi podľa neho budú dlhú dobu venovať pozornosť posolstvu, ktoré hlava katolíckej cirkvi priniesla.
Na letisku sa s Benediktom XVI. rozlúčili okrem Klausa, jeho manželky Livie a Vlka aj členovia Českej biskupskej konferencie či niektorí českí politici, vrátane vicepremiéra Jana Kohouta a predsedov oboch komôr parlamentu Přemysla Sobotku a Miloslava Vlčka. Skupina politikov a biskupov potom mávala leteckému špeciálu s pápežom, keď zamieril od letiskovej budovy na ranvej.
Pápežovi mávala aj skupina veriacich, ktorí sa s ním prišli na letisko rozlúčiť. Diváci s vlajkami Vatikánu nadšene tlieskali, keď pápež uzavrel svoj prejav českou vetou, pri jeho odchode do lietadla aj niektorí z nich skandovali pápežovo meno.
Na rozlúčkový ceremoniál dozerala jednotka hradnej stráže. Zúčastnilo sa ho aj niekoľko desiatok mladých ľudí v krojoch.