Janušek čelí od konca minulého roka výčitkám pre zákazku v prospech firiem údajne blízkych vládnej Slovenskej národnej strane (SNS). SNS, ako aj samotný Janušek postup ministerstva obhajovali, premiér Robert Fico viackrát vyhlásil, že ministra odvolá, ak kontrolné orgány zistia pochybenia pri tendri. „Keď tam nájdu porušenie zákona, čo verím, že nenájdu, tak pôjdem preč,“ vyhlásil pred novinármi Janušek.
NKÚ v súčasnosti posudzuje pripomienky, ktoré ministerstvo zaslalo k výsledkom kontroly. „Výsledky sú katastrofálne,“ citovali Hospodárske noviny (HN) zdroj zo SNS. Janušek sa nechcel vyjadrovať k prvým záverom kontrolórov, informácie nezverejnil ani NKÚ. „Treba si počkať na výsledné stanovisko tej kontroly,“ tvrdil Janušek. Zákazku preveruje aj Úrad pre verejné obstarávanie.
Ministerstvo výstavby ešte v roku 2007 vybralo za dodávateľa niektorých služieb potrebných na čerpanie peňazí z Európskej únie konzorcium s firmami Zamedia a Avocat, údajne blízkymi SNS. Napriek tomu, že išlo podľa médií o tender v hodnote asi 3,6 miliardy korún (podľa konverzného kurzu 119,5 milióna eur), ministerstvo vyvesilo informácie o vyhlásenej súťaži len na niekoľko dní na nástenke v budove úradu. Janušek tiež čelí podozreniam, že niektoré nákupy v rámci tendra boli predražené.
Sme v uplynulých dňoch napísalo, že predražené sumy si spoločnosť Zamedia účtovala aj za logá k operačným programom; reklamné agentúry by vraj ich vraj vedeli dodať za nižšie sumy. Janušek nevedel povedať, koľko logá stáli, podľa neho však išlo o celý takzvaný „design manuál“, návod na použitie na sedem rokov.
Pre tender sa dostali do sporu aj vládne strany SNS a ĽS-HZDS, ktorej nominant vedie NKÚ. Šéf SNS Ján Slota pre televíziu TA3 naznačoval, že predseda ĽS-HZDS Vladimír Mečiar mohol výsledky kontroly zmanipulovať, čo ĽS-HZDS odmietlo. Podľa HN bude SNS žiadať zas odvolanie ministra financií Jána Počiatka (Smer-SD), ak bude musieť z postu odísť Janušek. Počiatek čelil kritike za prehratý súdny spor národnej lotériovej spoločnosti Tipos.